Se você teve ou tem problema ao executar o comando Alt+F2 para executar um comando há um erro, esse bug foi relatados em alguns usuários.
Uma forma de contornar o problema, até que este esteja corrigido é:
$ sudo rm -rf ~/.gconf/apps/metacity/global_keybindings
E se tudo dê certo, você poderá utilizar o Alt + F2 como na captura de tela abaixo.
Meu Twitter: @AndreGondim
Abraços e boa sorte!! 
Conheça a comunidade Ubuntu Brasil
http://www.ubuntu-br.org/participe
Abraços
Luiz Augusto